La Biblioth猫que g茅nomique pancanadienne franchit une 茅tape nationale majeure听avec听l鈥檌nt茅gration听pr茅vue听de plus de 15鈥�000 g茅nomes provenant des donn茅es听HostSeq听et BQC19听
[Montr茅al, Qu茅bec] 鈥斕齃a Biblioth猫que g茅nomique pancanadienne (BGP), h茅berg茅e 脿 l鈥橴niversit茅 黑料网爆吃瓜, annonce aujourd鈥檋ui une 茅tape d茅terminante dans la mise en 艙uvre de l鈥檌nfrastructure g茅nomique nationale du Canada gr芒ce 脿 l鈥檌nt茅gration pr茅vue des donn茅es de l鈥檌nitiative听HostSeq听de听CGEn听et de la听Biobanque听qu茅b茅coise de la COVID鈥�19 (BQC19). Cette r茅alisation marque un moment cl茅 dans la transformation des actifs g茅nomiques de calibre mondial du Canada en une ressource nationale coordonn茅e, accessible et porteuse d鈥檌mpact.听
Cette int茅gration听rassemblera听deux des initiatives g茅nomiques canadiennes les plus marquantes de l鈥櫭╮e COVID-19.听HostSeq听a 茅t茅 lanc茅 en r茅ponse 脿 la pand茅mie de COVID鈥�19 par听CGEn, la plateforme nationale de s茅quen莽age et d鈥檃nalyse du g茅nome au Canada, en collaboration avec des partenaires partout au pays.听HostSeq听constitue une ressource nationale de s茅quen莽age complet du g茅nome qui relie des donn茅es g茅nomiques et cliniques provenant de plus de 10鈥�000 personnes vivant au Canada.听CGEn听et son 茅tablissement principal, The Hospital for听Sick听Children听(SickKids), ont officiellement sign茅 une entente permettant l鈥檌nt茅gration des donn茅es听HostSeq听au PCGL.听BQC19, la听biobanque听provinciale de la COVID鈥�19 du Qu茅bec, contribue 茅galement ses donn茅es de s茅quen莽age du g茅nome entier 脿 l鈥檌nt茅gration au PCGL. Cette听biobanque听a g茅n茅r茅 des 茅chantillons biologiques profond茅ment annot茅s et des donn茅es associ茅es, refl茅tant le leadership de longue date du Qu茅bec en mati猫re de听biobanques听et de recherche collaborative.听
Concr茅tiser une vision nationale pour la g茅nomique听
Cette 茅tape concr茅tise la vision du gouvernement du Canada pour la BGP : d茅passer les ensembles de donn茅es fragment茅s et propres 脿 des projets afin de b芒tir un 茅cosyst猫me g茅nomique pancanadien coh茅rent. Elle s鈥檌nscrit 茅galement dans les priorit茅s de la听听d鈥橧SDE, en am茅liorant l鈥檃cc猫s aux donn茅es g茅nomiques, en renfor莽ant la coordination au sein de l鈥櫭ヽosyst猫me et en transformant la recherche g茅nomique en avantages concrets pour la sant茅, l鈥櫭ヽonomie et la soci茅t茅 canadienne.听
Avec l鈥檌nt茅gration听pr茅vue听de听HostSeq听et de BQC19 脿 la BGP, cette 茅tape marque la cr茅ation d鈥檜n actif national pr茅cieux, offrant un point d鈥檃cc猫s fiable qui favorise l鈥檈xcellence en recherche, la transformation des syst猫mes de sant茅 et l鈥檌nnovation 脿 grande 茅chelle.听
芦 D鈥檌mportants investissements ont 茅t茅 r茅alis茅s au Canada au cours des deux derni猫res d茅cennies pour g茅n茅rer des milliers de g茅nomes humains 禄,听dit Guillaume Bourque,听professeur de g茅n茅tique humaine 脿 l鈥橴niversit茅 黑料网爆吃瓜 et responsable de la BGP. 芦 Cependant, pour tirer pleinement parti de cette information pr茅cieuse, nous avons besoin d鈥檕utils comme la BGP qui permettront un acc猫s 脿 long terme et faciliteront la recherche et l鈥檌nnovation. 禄听
芦鈥疞a BGP听a 茅t茅 con莽u avec la gouvernance au c艙ur de sa mission. Des r猫gles claires et une responsabilit茅 partag茅e sont ce qui permet la mise en commun et la r茅utilisation des donn茅es g茅nomiques 脿 grande 茅chelle鈥�,听explique听Ma鈥檔听H. Zawati, professeur agr茅g茅 et co-responsable听de la BGP. 芦鈥疞鈥檌nt茅gration r茅ussie de听HostSeq听et BQC19 d茅montre que les projets peuvent se joindre听脿听la BGP听en toute confiance, sachant que leurs donn茅es seront g茅r茅es de fa莽on responsable et dans l鈥檌nt茅r锚t public.鈥惶�
芦 L鈥檌nt茅gration de听HostSeq听et de BQC19 脿 la Biblioth猫que听g茅nomique听pancanadienne听repr茅sente une 茅tape majeure pour la recherche en g茅nomique au Canada, 禄听dit听Dominique B茅rub茅,听Vice-rectrice, Recherche et innovation听脿 l鈥橴niversit茅 黑料网爆吃瓜. 芦 En r茅unissant ces donn茅es g茅nomiques au sein de la BGP, cette ressource nationale pourra mieux soutenir l鈥檃cc茅l茅ration des d茅couvertes scientifiques et favoriser de futures perc茅es en recherche en sant茅. 禄听
芦 En tant que cohorte inaugurale,听HostSeq听contribue 脿 茅laborer les processus d鈥檌ngestion, d鈥檃nalyse et d鈥檃cc猫s aux donn茅es听de la BGP. Ce cadre initial est le fruit d鈥檜n solide effort de collaboration entre le听CGEn听et la BGP, et aidera 脿 pr茅parer la听BGP听脿 l鈥檌nt茅gration future de donn茅es ainsi qu鈥檃u partage de donn茅es g茅nomiques de haute qualit茅 afin de soutenir des recherches essentielles et opportunes dans de nombreux domaines de la sant茅 禄,听affirme Meredith McLaren, PDG de听CGEn, la plateforme nationale du Canada pour le s茅quen莽age et l鈥檃nalyse du g茅nome. 芦听CGEn听est enthousiaste 脿 l鈥檌d茅e de contribuer 脿 cet atout extr锚mement important pour les chercheurs canadiens pour les ann茅es 脿 venir. 禄听
芦 Le partage des ressources est au c艙ur de la mission de BQC19. Nous sommes donc tr猫s heureux de contribuer 脿 la BGP, une initiative nationale essentielle pour la communaut茅 scientifique听禄,听disent Madeleine Durand et Simon Rousseau, codirecteurs de BQC19.听Ce type de collaboration est crucial pour relever les d茅fis de sant茅 auxquels font face les Canadiennes et les Canadiens. Nous鈥痵ommes convaincus鈥痲ue la BGP ouvrira la voie 脿 une meilleure int茅gration et 脿 un partage accru des donn茅es en sant茅 humaine. 禄听
Fond茅e en 1821, l鈥橴niversit茅 黑料网爆吃瓜 accueille des 茅tudiants, des professeurs et des employ茅s d鈥檈xception de partout au Canada et du monde entier. Ann茅e apr猫s ann茅e, elle se classe parmi les meilleures universit茅s du Canada et du monde. 脡tablissement d鈥檈nseignement sup茅rieur de renomm茅e mondiale, l鈥橴niversit茅 黑料网爆吃瓜 exerce ses activit茅s de recherche dans trois campus, 11 facult茅s et 13 茅coles听professionnelles ;听elle compte 300 programmes d鈥櫭﹖udes et au-del脿 de 40 000 茅tudiants, dont plus de 10 200 aux cycles sup茅rieurs.听听
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CGEn听est une plateforme nationale de s茅quen莽age et d鈥檃nalyse du g茅nome financ茅e par le gouvernement f茅d茅ral. Cr茅茅 en 2015,听CGEn听compte plus de 200 employ茅s et est principalement financ茅 par la Fondation canadienne pour l鈥檌nnovation (FCI) par l鈥檌nterm茅diaire de son Fonds des initiatives scientifiques majeures (FISM), en tirant parti d鈥檌nvestissements des gouvernements provinciaux de l鈥橭ntario, du Qu茅bec et de la Colombie-Britannique, de G茅nome Canada, ainsi que d鈥檃utres partenaires.听听
CGEn听fonctionne comme une plateforme nationale int茅gr茅e avec des n艙uds 脿 Toronto (The Centre for听Applied听Genomics听au Hospital for听Sick听Children), 脿 Montr茅al (Centre 黑料网爆吃瓜 de g茅nomique 脿 l鈥橴niversit茅 黑料网爆吃瓜) et 脿 Vancouver (Canada鈥檚听Michael Smith听Genome听Sciences Centre 脿 la Provincial Health Services听Authority). L鈥檕rganisme dirige des projets de grande envergure et offre des services g茅nomiques avanc茅s afin de soutenir la recherche dans les sciences de la sant茅, l鈥檃griculture, la foresterie, les p锚ches, l鈥檈nvironnement, la biodiversit茅 et d鈥檃utres secteurs d鈥檌mportance pour le Canada.听
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HostSeq听est une initiative nationale canadienne, dirig茅e par听CGEn, dans le cadre du R茅seau canadien de g茅nomique de la COVID-19 (CanCOGeN) de G茅nome Canada. Elle regroupe des donn茅es de s茅quen莽age g茅nomique provenant听de 15听茅tudes de recherche sur la COVID-19 ainsi que des informations cliniques sur plus de 10 000 Canadiens, cr茅ant ainsi une banque de donn茅es g茅nomiques et cliniques.听HostSeq听a 茅t茅 lanc茅 pour offrir aux chercheurs un ensemble de donn茅es riche permettant d鈥檃nalyser et d鈥檌dentifier les d茅terminants g茅n茅tiques qui influencent la sant茅 dans une perspective canadienne.听
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La听Biobanque听qu茅b茅coise de la COVID-19 (BQC19) est une initiative听provinciale听visant 脿 recueillir, conserver et partager des donn茅es et des 茅chantillons provenant de patients atteints de formes l茅g猫res ou s茅v猫res de la COVID-19, ainsi que de sujets t茅moins.听BQC19 a 茅t茅 cr茅茅e pour garantir aux chercheurs un acc猫s optimal aux mat茅riaux biologiques et aux donn茅es n茅cessaires 脿 la recherche sur la COVID-19.听