脡惫茅苍别尘别苍迟 | RNA-Seq Bootcamp
Du 1er au 5 juin 2026, la 听,听 en partenariat avec听 ainsi que la 听, et le听, organiseront un bootcamp sur le RNA鈥憇eq.
Ce bootcamp, compos茅 de cinq modules, est con莽u pour accompagner les participant路e路s, depuis les bases de la navigation en ligne de commande jusqu鈥櫭� l鈥檈x茅cution de flux de travail bioinformatiques avanc茅s et reproductibles pour l鈥檃nalyse RNA鈥憇eq. Le programme d茅bute par l鈥檃cquisition de comp茅tences essentielles en UNIX et des m茅thodes de r茅cup茅ration de donn茅es, puis progresse vers la conception exp茅rimentale et les principales 茅tapes de pr茅traitement, notamment le contr么le de qualit茅, l鈥檃lignement des lectures et leur quantification.
Les participant路e路s seront ensuite initi茅路e路s 脿 l鈥檃nalyse de l鈥檈xpression g茅nique diff茅rentielle (DGE), apprenant 脿 appliquer des mod猫les statistiques appropri茅s et 脿 g茅rer des plans exp茅rimentaux complexes et multifactoriels 脿 l鈥檃ide de DESeq2, ainsi qu鈥櫭� explorer des m茅thodes d鈥檈nrichissement fonctionnel (ORA et GSEA). Enfin, les participant路e路s apprendront 脿 d茅ployer des pipelines standardis茅s (Nextflow et GenPipes) sur des environnements de calcul haute performance (HPC) utilisant des ordonnanceurs SLURM, avant de conclure par une s茅ance d茅di茅e au d茅pannage afin de soutenir les applications de recherche autonomes.
Programme
Inscription
Ces sessions sont offertes en format hybride : elles sont accessibles 脿 la fois en ligne et en pr茅sentiel鈥�!